Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN7

ROGDI, Protein rogdi homolog, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDIQ9GZN7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROGDIQ9GZN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROGDIQ9GZN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROGDIQ9GZN7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROGDIQ9GZN7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms