Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CIPCQ9C0C6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIPCQ9C0C6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CIPCQ9C0C6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIPCQ9C0C6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms