Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRINP2Q9C0B6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRINP2Q9C0B6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRINP2Q9C0B6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms