Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM7Q9C029 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM7Q9C029 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM7Q9C029 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms