Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM6SF2Q9BZW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM6SF2Q9BZW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF2Q9BZW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms