Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFIH1Q9BYX4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFIH1Q9BYX4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFIH1Q9BYX4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms