Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT3Q9BYD9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT3Q9BYD9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms