Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1M1Q9BXS5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1M1Q9BXS5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP1M1Q9BXS5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms