Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS2Q9BXC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS2Q9BXC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS2Q9BXC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms