Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFT27Q9BW83 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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