Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC11Q9BVV2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC11Q9BVV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms