Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN3Q9BTN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRFN3Q9BTN0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms