Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RTKNQ9BST9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTKNQ9BST9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms