Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM79Q9BSE2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms