Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPKQ9BS16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPKQ9BS16 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPKQ9BS16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPKQ9BS16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms