Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAAF1Q9BRP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAAF1Q9BRP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PAAF1Q9BRP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAAF1Q9BRP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms