Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOXF2Q9BQY4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOXF2Q9BQY4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOXF2Q9BQY4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOXF2Q9BQY4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.3 ms