Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOPXQ9BPY8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOPXQ9BPY8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOPXQ9BPY8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms