Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3CQ99985 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3CQ99985 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms