Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUSP9Q99956 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUSP9Q99956 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP9Q99956 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms