Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB1Q99828 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIB1Q99828 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms