Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BARD1Q99728 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARD1Q99728 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms