Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHOX2BQ99453 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PHOX2BQ99453 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHOX2BQ99453 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms