Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPK1Q96SB4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms