Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNL2Q96S94 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL2Q96S94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms