Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
IFT140Q96RY7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.46■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
IFT140Q96RY7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
IFT140Q96RY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC41.34■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
IFT140Q96RY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms