Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HHIPQ96QV1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HHIPQ96QV1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms