Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALPK1Q96QP1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK1Q96QP1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms