Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK15Q96Q40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK15Q96Q40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK15Q96Q40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK15Q96Q40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms