Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZIM3Q96PE6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZIM3Q96PE6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZIM3Q96PE6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms