Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAMD11Q96NU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD11Q96NU1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms