Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNDC3BQ96NL0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNDC3BQ96NL0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC3BQ96NL0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms