Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN5Q96NI6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN5Q96NI6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms