Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1Q96NA8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms