Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZSWIM3Q96MP5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZSWIM3Q96MP5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM3Q96MP5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms