Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMCE3Q96MG7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE3Q96MG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms