Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf66Q96MD2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C12orf66Q96MD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf66Q96MD2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms