Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT74Q96LB3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT74Q96LB3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT74Q96LB3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT74Q96LB3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT74Q96LB3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT74Q96LB3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT74Q96LB3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT74Q96LB3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms