Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX22Q96L94 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX22Q96L94 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX22Q96L94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms