Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHAMP1Q96JM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms