Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L3Q96J77 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPD52L3Q96J77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms