Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SGSM3Q96HU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGSM3Q96HU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGSM3Q96HU1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms