Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VMP1Q96GC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VMP1Q96GC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMP1Q96GC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms