Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LTV1Q96GA3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LTV1Q96GA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTV1Q96GA3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms