Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1Q96FS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIPA1Q96FS4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms