Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3IP1Q96FE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3IP1Q96FE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms