Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL3Q96EH8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms