Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN1Q96DB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 420.8 ms