Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD1Q96CP7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLCD1Q96CP7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms