Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD2Q96BF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms